Franche-Comté
E
- Échampés (les), v. Mouthe
- Échay, v. Quingey
- Échelles de la Mort (les), v. Charquemont
- Échenoz-la-Méline
- Échenoz-le-Sec, v. Montbozon
- Éclangeot, v. Rochefort-sur-Nenon
- Éclans-Nenon, v. Rochefort-sur-Nenon
- École-Valentin
- Écorces (Les), v. Maîche
- Écot, v. Pont-de-Roide
- Écoulottes (r. des), v. Autrey-lès-Gray
- Écrevisse (l’), r., v. Delle
- Éguenigue, v. Fontaine
- Éloie, v. Offemont
- Émagny, v. Audeux
- Embossieux (l’), v. Bouchoux (Les)
- Encroches (les), v. Morez
- Entre Dessoubre et Barbêche (communauté de communes)
- Entre-deux-Monts, v. Planches-en-Montagne (Les)
- Entre les Fougs, v. Mouthe
- Entreportes (cluse d’), v. Pontarlier
- Entre-Roches (défilé d’), v. Montbenoît
- Entre Serre et Chaux (communauté de communes), v. Jura entre Serre et Chaux
- Épais Rochers (défilé des), v. Pierrefontaine-les-Varans
- Épenottes (les), v. Villersexel
- Épenoy, v. Vercel-Villedieu-le-Camp
- Épinois (les), v. Planches-en-Montagne (Les)
- Épy, v. Saint-Amour
- Équevilley, v. Port-sur-Saône
- Équevillon, v. Champagnole
- Ermitage (l’), v. Luxeuil-les-Bains
- Ermite (grotte de l’), v. Pierrefontaine-les-Varans
- Essard (à Villard-Saint-Sauveur, v. Saint-Claude
- Essarts (les) (à Pelousey), v. Audeux
- Essarts-Martin (les), v. Boussières
- Essavilly, v. Nozeroy
- Essernay, v. Noroy-le-Bourg
- Essert
- Essertenne-et-Cecey, v. Autrey-lès-Gray
- Esserval-Tartre, v. Nozeroy
- Est (canal de l’)
- Étalans, v. Vercel-Villedieu-le-Camp
- Étang (r. de l’), v. Danjoutin
- Étang Neuf (l’), v. Jussey
- Éternoz, v. Amancey
- Étival, v. Moirans-en-Montagne
- Étoile (L’), v. Lons-le-Saunier
- Étroitefontaine, v. Villersexel
- Étueffont, v. Rougemont-le-Château
- Étupes
- Euthe, v. Heute
- Évette-Salbert
- Évillers, v. Levier
- Exincourt
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